Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPAP53621 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPAP53621 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPAP53621 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPAP53621 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPAP53621 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPAP53621 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPAP53621 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPAP53621 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPAP53621 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPAP53621 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPAP53621 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPAP53621 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPAP53621 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPAP53621 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms