Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT4P50991 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT4P50991 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT4P50991 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT4P50991 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT4P50991 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT4P50991 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT4P50991 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT4P50991 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT4P50991 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT4P50991 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT4P50991 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT4P50991 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCT4P50991 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT4P50991 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT4P50991 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT4P50991 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT4P50991 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms