Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP153P49790 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP153P49790 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP153P49790 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP153P49790 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP153P49790 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms