Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms