Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM4P49221 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM4P49221 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM4P49221 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM4P49221 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM4P49221 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM4P49221 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM4P49221 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM4P49221 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TGM4P49221 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM4P49221 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM4P49221 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM4P49221 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM4P49221 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms