Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRPC1P48995 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms