Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRATP43155 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRATP43155 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRATP43155 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRATP43155 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRATP43155 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRATP43155 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRATP43155 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRATP43155 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRATP43155 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRATP43155 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRATP43155 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms