Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDF5P43026 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDF5P43026 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDF5P43026 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDF5P43026 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDF5P43026 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDF5P43026 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDF5P43026 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDF5P43026 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GDF5P43026 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms