Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms