Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms