Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB3O43889 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB3O43889 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB3O43889 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREB3O43889 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms