Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms