Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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