Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms