Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms