Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
R3HCC1Q9Y3T6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HCC1Q9Y3T6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms