Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms