Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF24Q9UPV7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms