Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT172Q9UG01 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms