Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC180Q9P1Z9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC180Q9P1Z9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms