Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF275Q9NSD4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF275Q9NSD4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms