Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms