Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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