Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC1Q96C34 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms