Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM41Q8WV44 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM41Q8WV44 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms