Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms