Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms