Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms