Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD1Q5VV17 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms