Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OBSCNQ5VST9 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms