Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms