Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms