Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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