Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1SQ13698 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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