Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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