Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms