Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 LINC02262-201ENST00000416680 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TTTY7-201ENST00000276770 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TTTY7B-201ENST00000276779 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 P2RX6P-201ENST00000439119 468 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TDGF1-205ENST00000542931 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms