Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHDQ02161 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHDQ02161 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms