Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms