Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGDSP41222 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGDSP41222 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms