Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGCXP38435 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGCXP38435 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGCXP38435 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GGCXP38435 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms