Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHC1P29353 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHC1P29353 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms