Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD34P28906 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD34P28906 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms