Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms