Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYF6P23409 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYF6P23409 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYF6P23409 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYF6P23409 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYF6P23409 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYF6P23409 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms