Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRHP20396 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRHP20396 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRHP20396 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRHP20396 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRHP20396 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms