Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CBSLP0DN79 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms