Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APBA3O96018 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APBA3O96018 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APBA3O96018 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APBA3O96018 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms