Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms