Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SSPOA2VEC9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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